Исследования

Молекулярный контроль ангидробиоза

Ангидробиоз — это способность ряда организмов входить в аметаболическое состояние после полного высыхания. В сухой форме эти организмы сохраняют жизнеспособность в течении многих лет и быстро восстанавливаются при регидратации. Мы изучаем самый большой и самый сложный ангидробиотический организм – личинку африканского комара Polypedilum vanderplanki (спящую хирономиду). Используя комбинацию самых передовых технологий, в том числе анализ клеток in vitro, NGS, транскриптомику отдельных клеток, Hi-C и редактирование генома, мы изучаем молекулярный механизмы ангидробиоза, включая сеть регуляции генов, координированную активность защитных белков, происхождение и эволюцию толерантности к полному высыханию. Мы также разрабатываем методы и систему скрининга для переноса толерантности к стрессу ангидробиотических организмов в других насекомых и клетки млекопитающих для нужд сельского хозяйства и биомедицинских целей.

Геномика наследственных форм рак

Наследственный рак молочной железы и яичников (HBOC) является одним из наиболее частых моногенных онкозаболеваний. Был идентифицирован ряд высокопенетрантных (BRCA1 и BRCA2, PTEN, TP53, CDH1 и STK11), умереннопенетрантных (PALB2, ATM, BRIP1 и CHEK2) генов. Методы высокопроизводительного секвенирования и снижение стоимости привели к использованию генных панелей для клинических исследований и быстрого накопления данных по идентификации патогенных мутаций. Мы запустили проект «Наследственная онкогеномика России» для изучения наследственных онкологических болезней в Российской Федерации с целью создания крупнейшего биобанка образцов крови и базы данных патогенных мутаций в генах, связанных с раком.

Генно-регуляторная сеть мышц млекопитающих (консорциум FANTOM Muscles)

Скелетные мышцы играют важную роль во многих жизненно важных процессах и поддерживаются многочисленными механизмами, регулирующими синтез и деградацию белка. Мышечная атрофия может влиять на специфические типы волокон и различные мышцы, имеющие дифференциальную восприимчивость к мышечным истощениям. Однако регуляторные факторы, лежащие в основе этих различий, еще предстоит выяснить. В рамках международного консорциума мы реконструируем транскрипционные сети РНК в различных мышцах в нормальных и атрофических условиях с использованием анализа Cap Analysis of Gene Expression (CAGE) и анализа экспрессии малых РНК. Часть исследования посвящена спортивной медицине и космической биологии для понимания изменений транскрипционной сети мышц при атрофии во время космического полета.